MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011981	ATG	2	6	183136	183141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102576
3002	NC_011981	TGG	2	6	183238	183243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102577
3003	NC_011981	TTG	2	6	183264	183269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102577
3004	NC_011981	CTC	2	6	183347	183352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102577
3005	NC_011981	GCG	2	6	183384	183389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
3006	NC_011981	CAG	2	6	183725	183730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102577
3007	NC_011981	T	6	6	183740	183745	0 %	100 %	0 %	0 %	222102577
3008	NC_011981	TCG	2	6	183774	183779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102577
3009	NC_011981	CCG	2	6	183796	183801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102577
3010	NC_011981	GCCGT	2	10	183825	183834	0 %	20 %	40 %	40 %	222102577
3011	NC_011981	ATG	2	6	183849	183854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102577
3012	NC_011981	ATT	2	6	183944	183949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102577
3013	NC_011981	GGC	2	6	184067	184072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
3014	NC_011981	TTC	2	6	184178	184183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102577
3015	NC_011981	GGCGTA	2	12	184247	184258	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222102577
3016	NC_011981	GC	3	6	184299	184304	0 %	0 %	50 %	50 %	222102577
3017	NC_011981	GGCT	2	8	184316	184323	0 %	25 %	50 %	25 %	222102577
3018	NC_011981	CAC	2	6	184331	184336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102577
3019	NC_011981	CGG	2	6	184339	184344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
3020	NC_011981	CAG	2	6	184421	184426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102577
3021	NC_011981	CAT	2	6	184462	184467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102577
3022	NC_011981	CGG	2	6	184513	184518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
3023	NC_011981	TGG	2	6	184594	184599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102577
3024	NC_011981	TGGTGT	2	12	184615	184626	0 %	50 %	50 %	0 %	222102577
3025	NC_011981	GTT	2	6	184644	184649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102577
3026	NC_011981	GCC	2	6	184679	184684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102577
3027	NC_011981	TTC	2	6	184686	184691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102577
3028	NC_011981	CCA	2	6	184734	184739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102577
3029	NC_011981	GGC	2	6	184742	184747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
3030	NC_011981	CAA	2	6	184754	184759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102577
3031	NC_011981	GCG	2	6	184766	184771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
3032	NC_011981	GGC	2	6	184835	184840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102578
3033	NC_011981	CCA	2	6	184855	184860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102578
3034	NC_011981	CAT	2	6	184897	184902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102578
3035	NC_011981	CAA	2	6	184903	184908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102578
3036	NC_011981	GGGC	2	8	184924	184931	0 %	0 %	75 %	25 %	222102578
3037	NC_011981	CTG	2	6	185080	185085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102578
3038	NC_011981	TTG	2	6	185091	185096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102578
3039	NC_011981	GCG	2	6	185148	185153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102578
3040	NC_011981	ACA	2	6	185293	185298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102578
3041	NC_011981	GCA	2	6	185400	185405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102578
3042	NC_011981	TCA	2	6	185523	185528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102578
3043	NC_011981	ATC	2	6	185559	185564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102578
3044	NC_011981	CGC	2	6	185572	185577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102578
3045	NC_011981	CGG	2	6	185590	185595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102578
3046	NC_011981	TGG	2	6	185668	185673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102578
3047	NC_011981	CAT	2	6	185680	185685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102578
3048	NC_011981	CG	3	6	185768	185773	0 %	0 %	50 %	50 %	222102578
3049	NC_011981	CAC	2	6	185819	185824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102578
3050	NC_011981	ATCA	2	8	185981	185988	50 %	25 %	0 %	25 %	222102578
3051	NC_011981	GAG	2	6	186015	186020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102578
3052	NC_011981	AAT	2	6	186161	186166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102579
3053	NC_011981	TCG	2	6	186172	186177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102579
3054	NC_011981	CCA	2	6	186242	186247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102579
3055	NC_011981	GAT	2	6	186264	186269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102579
3056	NC_011981	CTTG	2	8	186296	186303	0 %	50 %	25 %	25 %	222102579
3057	NC_011981	GCCACG	2	12	186315	186326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222102579
3058	NC_011981	CATG	2	8	186328	186335	25 %	25 %	25 %	25 %	222102579
3059	NC_011981	TTG	2	6	186352	186357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102579
3060	NC_011981	TTG	2	6	186378	186383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102579
3061	NC_011981	TGCC	2	8	186389	186396	0 %	25 %	25 %	50 %	222102579
3062	NC_011981	CAC	2	6	186444	186449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102579
3063	NC_011981	TGA	2	6	186458	186463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102579
3064	NC_011981	AGG	2	6	186485	186490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102579
3065	NC_011981	GGC	2	6	186507	186512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102579
3066	NC_011981	GC	3	6	186551	186556	0 %	0 %	50 %	50 %	222102579
3067	NC_011981	GGCG	2	8	186590	186597	0 %	0 %	75 %	25 %	222102579
3068	NC_011981	GGC	2	6	186640	186645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102579
3069	NC_011981	GTT	2	6	186678	186683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102579
3070	NC_011981	ATGG	2	8	186936	186943	25 %	25 %	50 %	0 %	222102579
3071	NC_011981	CAG	2	6	186951	186956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102579
3072	NC_011981	TGG	2	6	186962	186967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102579
3073	NC_011981	GCC	2	6	187026	187031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102579
3074	NC_011981	CAC	2	6	187092	187097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102579
3075	NC_011981	TGG	2	6	187130	187135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102579
3076	NC_011981	ATA	2	6	188021	188026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102580
3077	NC_011981	TCT	2	6	188086	188091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102580
3078	NC_011981	GGCT	2	8	188223	188230	0 %	25 %	50 %	25 %	222102580
3079	NC_011981	CAA	2	6	188232	188237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102580
3080	NC_011981	TCGA	2	8	188263	188270	25 %	25 %	25 %	25 %	222102580
3081	NC_011981	GCT	2	6	188290	188295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102580
3082	NC_011981	CTG	2	6	188402	188407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102580
3083	NC_011981	GC	4	8	188466	188473	0 %	0 %	50 %	50 %	222102580
3084	NC_011981	GCT	2	6	188544	188549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102580
3085	NC_011981	GCG	2	6	188552	188557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102580
3086	NC_011981	AC	3	6	188666	188671	50 %	0 %	0 %	50 %	222102580
3087	NC_011981	GAA	2	6	188782	188787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102580
3088	NC_011981	TCA	2	6	188842	188847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102580
3089	NC_011981	CCAGC	2	10	188860	188869	20 %	0 %	20 %	60 %	222102580
3090	NC_011981	TGAT	2	8	188957	188964	25 %	50 %	25 %	0 %	222102580
3091	NC_011981	AAAGC	2	10	189054	189063	60 %	0 %	20 %	20 %	222102581
3092	NC_011981	CCT	3	9	189075	189083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102581
3093	NC_011981	TGC	3	9	189112	189120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102581
3094	NC_011981	TGG	2	6	189267	189272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102581
3095	NC_011981	CAC	2	6	189352	189357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102581
3096	NC_011981	ACG	2	6	189361	189366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102581
3097	NC_011981	GCT	2	6	189367	189372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102581
3098	NC_011981	TCCA	2	8	189403	189410	25 %	25 %	0 %	50 %	222102581
3099	NC_011981	TTG	2	6	189543	189548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102581
3100	NC_011981	TGC	2	6	189612	189617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102581
3101	NC_011981	TGG	2	6	189669	189674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102581
3102	NC_011981	GGGCT	2	10	189701	189710	0 %	20 %	60 %	20 %	222102581
3103	NC_011981	GTTG	2	8	189715	189722	0 %	50 %	50 %	0 %	222102581
3104	NC_011981	GCA	2	6	189727	189732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102581
3105	NC_011981	ATC	2	6	189752	189757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102581
3106	NC_011981	GCT	2	6	189802	189807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102581
3107	NC_011981	TGC	2	6	189828	189833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102581
3108	NC_011981	TGG	2	6	189850	189855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102581
3109	NC_011981	TGT	2	6	189869	189874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102582
3110	NC_011981	TGC	2	6	189998	190003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102582
3111	NC_011981	ACCA	2	8	190022	190029	50 %	0 %	0 %	50 %	222102582
3112	NC_011981	TCA	2	6	190061	190066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102582
3113	NC_011981	TGC	2	6	190112	190117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102582
3114	NC_011981	ATA	2	6	190136	190141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102582
3115	NC_011981	CG	3	6	190285	190290	0 %	0 %	50 %	50 %	222102582
3116	NC_011981	GTT	3	9	190311	190319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102582
3117	NC_011981	CCT	2	6	190374	190379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102582
3118	NC_011981	TGC	2	6	190749	190754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102583
3119	NC_011981	GCT	2	6	190757	190762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102583
3120	NC_011981	TGGT	2	8	190881	190888	0 %	50 %	50 %	0 %	222102583
3121	NC_011981	GCC	2	6	190916	190921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102583
3122	NC_011981	GGAA	2	8	190948	190955	50 %	0 %	50 %	0 %	222102583
3123	NC_011981	GGAT	2	8	190960	190967	25 %	25 %	50 %	0 %	222102583
3124	NC_011981	ATCA	2	8	191006	191013	50 %	25 %	0 %	25 %	222102583
3125	NC_011981	TGA	2	6	191098	191103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102583
3126	NC_011981	AAT	2	6	191105	191110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102583
3127	NC_011981	A	6	6	191138	191143	100 %	0 %	0 %	0 %	222102583
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3130	NC_011981	TGGT	2	8	191202	191209	0 %	50 %	50 %	0 %	222102583
3131	NC_011981	CGT	2	6	191249	191254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102583
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3152	NC_011981	ATG	2	6	192251	192256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102584
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3154	NC_011981	TGC	2	6	192395	192400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102585
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3228	NC_011981	GGCG	2	8	196323	196330	0 %	0 %	75 %	25 %	222102589
3229	NC_011981	ATT	2	6	196343	196348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102589
3230	NC_011981	CT	3	6	196443	196448	0 %	50 %	0 %	50 %	222102589
3231	NC_011981	TTGCCA	2	12	196490	196501	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222102589
3232	NC_011981	CTGTTG	2	12	196528	196539	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222102589
3233	NC_011981	CGA	2	6	196593	196598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102589
3234	NC_011981	TCG	2	6	196601	196606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102589
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3238	NC_011981	TGGCA	2	10	196907	196916	20 %	20 %	40 %	20 %	222102589
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3240	NC_011981	TGC	2	6	196930	196935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102590
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3242	NC_011981	TTG	2	6	197178	197183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102590
3243	NC_011981	TGG	2	6	197227	197232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102590
3244	NC_011981	ATG	2	6	197257	197262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102590
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3246	NC_011981	CGC	3	9	197280	197288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102590
3247	NC_011981	CTG	2	6	197316	197321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102590
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3360	NC_011981	GATT	2	8	204924	204931	25 %	50 %	25 %	0 %	222102597
3361	NC_011981	AGC	2	6	205270	205275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102598
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3363	NC_011981	CGA	2	6	205343	205348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102598
3364	NC_011981	CG	3	6	205393	205398	0 %	0 %	50 %	50 %	222102598
3365	NC_011981	CAG	2	6	205853	205858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102599
3366	NC_011981	ATG	2	6	205897	205902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102599
3367	NC_011981	GCG	2	6	205906	205911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102599
3368	NC_011981	TTC	2	6	206097	206102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102599
3369	NC_011981	GGC	2	6	206167	206172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102599
3370	NC_011981	TGTC	2	8	206186	206193	0 %	50 %	25 %	25 %	222102599
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3372	NC_011981	TGGAC	2	10	207338	207347	20 %	20 %	40 %	20 %	222102600
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3376	NC_011981	TGC	2	6	207496	207501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102600
3377	NC_011981	CAT	2	6	207504	207509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102600
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3380	NC_011981	CGG	2	6	207646	207651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102600
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3382	NC_011981	CA	3	6	207690	207695	50 %	0 %	0 %	50 %	222102600
3383	NC_011981	CAGC	2	8	207780	207787	25 %	0 %	25 %	50 %	222102600
3384	NC_011981	TCA	2	6	207809	207814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102600
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3386	NC_011981	CTT	2	6	207882	207887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102600
3387	NC_011981	GTT	2	6	207924	207929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102600
3388	NC_011981	CGA	4	12	207941	207952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102600
3389	NC_011981	CCA	2	6	207977	207982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102600
3390	NC_011981	TGC	2	6	208037	208042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102600
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3392	NC_011981	CACC	2	8	208444	208451	25 %	0 %	0 %	75 %	222102601
3393	NC_011981	CCCG	2	8	208502	208509	0 %	0 %	25 %	75 %	222102601
3394	NC_011981	CGAT	2	8	208515	208522	25 %	25 %	25 %	25 %	222102601
3395	NC_011981	CTG	2	6	208558	208563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102601
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3397	NC_011981	TGA	2	6	208596	208601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102601
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3399	NC_011981	ATG	2	6	208720	208725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102601
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3401	NC_011981	ATA	2	6	208745	208750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102601
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3403	NC_011981	CTG	2	6	208813	208818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102601
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3470	NC_011981	GCC	2	6	212507	212512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102605
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3480	NC_011981	CGC	3	9	212992	213000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102605
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3482	NC_011981	GCCA	2	8	213265	213272	25 %	0 %	25 %	50 %	222102606
3483	NC_011981	GCA	2	6	213304	213309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102606
3484	NC_011981	CTT	2	6	213324	213329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102606
3485	NC_011981	CAG	2	6	213383	213388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102606
3486	NC_011981	GGCA	2	8	213574	213581	25 %	0 %	50 %	25 %	222102606
3487	NC_011981	CTTGC	2	10	213605	213614	0 %	40 %	20 %	40 %	222102606
3488	NC_011981	GAA	2	6	213661	213666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102606
3489	NC_011981	GTG	2	6	213753	213758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102606
3490	NC_011981	CTG	2	6	213826	213831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102606
3491	NC_011981	CGG	2	6	213864	213869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102606
3492	NC_011981	CAG	2	6	213979	213984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102606
3493	NC_011981	GCC	2	6	214028	214033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102606
3494	NC_011981	CGGA	2	8	214047	214054	25 %	0 %	50 %	25 %	222102606
3495	NC_011981	CCG	2	6	214083	214088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102606
3496	NC_011981	TCG	2	6	214145	214150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102606
3497	NC_011981	GAC	2	6	214175	214180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102606
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3499	NC_011981	GTC	2	6	214267	214272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102606
3500	NC_011981	GAC	2	6	214290	214295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102606

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